אגף הכספים

האגף מונה כ- 46 עובדים. החשבות מנהלת את ביצוע תקציבו של משרד ראש הממשלה ומשרדי ליווין נוספים בהתאם להחלטות הממשלה. 

פעילות חשבות המשרד היא ייחודיות מכיוון שהיא חולשת על יחידות ומשרדים רבים, אשר כפופים למשרד ראש הממשלה כחלק מחשבות המשרד פועלת גם יחידת השכר שמשלמת את שכרם של כלל עובדי משרד רה"מ ויתר המשרדים והיחידות כפי שפורט לעיל. 

מלבד זאת חשבות המשרד משמשת כיחידת כספים כלל ממשלתית בשני תחומים:

1 . תשלום שכרם של כלל שרי הממשלה.
2 . ביצוע תקציב אבטחת שרים.

פעולותיה של החשבות באגף הכספים, מבוצעות בהתאם לחוק התקציב, חוק חובת מכרזים, חוק נכסי המדינה והנהלים השונים, לרבות הנחיות היועץ המשפטי לממשלה, נציבות שירות המדינה והחשב הכללי.
בהתאם לעיקרון הפרדת הסמכויות, חשב המשרד וסגניו הינם עובדי החשב הכללי ועל פי חוק נכסי המדינה, חתימתם, בצירוף חתימת מורשה חתימה נוסף, מהווה תנאי לצורך ביצוע התחייבות שלטונית כדין.
לחשב המשרד 7 סגנים שמכהנים בפועל כחשבי משרדי הממשלה והיחידות שפורטו לעיל ונותנים מענה ושירות באמצעות מחלקות החשבות השונות.

משימות האגף 

אגף הכספים וחשבות המשרד מהווה יחידת מטה בתוך משרד ראש הממשלה ואחראית על מכלול הפעילות הכספית והחשבונאית במשרד, לרבות:

• השתתפות בוועדות המכרזים ובוועדות נוספות.
• קביעת התנאים הכספיים בהתקשרויות המשרד.
• פתיחת מוטבים וניהולם.
• ביצוע פיקוח ובקרה תקציבית. ביצוע תשלומים לספקים, משרדי ממשלה, רשויות ולעובדים.
• טיפול בנסיעות לחו"ל.
• גבייה ורישום הכנסות.
• ניהול ודיווח חשבונאי של הפעילות הכספית של המשרד.
• הפקת דוחות כספיים.
• ביצוע ביקורת פנימית של עבודות החשבות והמשרד באמצעות מבקרי כספים.