מעבדה למיקרוביולוגיה קלינית

המעבדה למיקרוביולוגיה קלינית ומחלות זיהומיות עוסקת באבחון, טיפול ומניעת מחלות זיהומיות באמצעות השיטות המתקדמות ביותר במיקרוביולוגיה לרבות שיטות מולקולריות שבהן  Real Time-Polymerase Chain Reaction (RT- PCR). המעבדה נותנת שירותי אבחון של פתוגנים שונים כגון: חיידקים, וירוסים, פטריות ופרזיטים, למטופלי המרכז הרפואי בני ציון ולגורמים חיצוניים. המעבדה המיקרוביולוגית היחידה בארץ המבצעת סקירה אוניברסליות (universal screening) לכל היילודים הנולדים בבית החולים לוירוס Cytomegaloviurs CMV) ). מטרת בדיקות סקירה אלו היא לאתר ילודים עם CMV מולד מוקדם ככל הניתן על מנת להתחיל טיפול בעיתוי בו תועלת הטיפול היא המרבית למניעת ליקויים משמעותיים בהתפתחות ובשמיעה. 
המעבדה משלבת בתוכה עובדי מעבדה עם תארים מתקדמים ((PhD, M.Sc וכן רופאים המומחים למחלות זיהומיות. המעבדה עובדת בכל ימות השבוע. הבדיקות מתקבלות מהשעה 07:00 בבוקר ועד ל- 23:00 בערב. למקרים דחופים ישנו כונן לאחר שעות העבודה. 

המעבדה כוללת יחידות שונות מתחומי המיקרוביולוגיה הקלינית:
מעבדה בקטריולוגית  המאבחנת חיידקים ופטריות ב: זיהומים במחזור הדם, זיהומים בנוזלי גוף, זיהומים לאחר ניתוח, זיהומים במע' הנשימה, זיהומים במע' האורוגנטלית, זיהומים במע' אף אוזן גרון, זיהומי עיניים וזיהומים הגורמים לדלקת קרום המוח. 

יחידה לבדיקות ביולוגיה מולקולרית המבצעת אבחון מהיר של זיהומים שונים באמצעות RNA/DNA של הפתוגנים השונים ב- RT- PCR.

יחידה לבדיקות סרולוגיות המאבחנת מחוללים ויראלים וחיידקים ע"י בדיקת נוגדנים הנוצרים בגוף עקב מחלות זיהומיות שונות. 

מעבדת קורונה הבודקת בשיטות מולקולאריות מתקדמות את וירוס הקורונה SARS CoV-2 וכן את הנוגדנים הנוצרים בעקבות חשיפה לוירוס במחלימי המחלה או את התגובה החיסונית לחיסון כנגד הוירוס.
שיטות האבחון המיושמות במעבדה כוללות טכניקות מיקרוביולוגיות קלאסיות שבהם מזהים את סוג החיידק וקובעים את רגישותו לגבי התרופות האנטיביוטיות השונות וכן טכניקות של ביולוגיה מולקולרית (PCR) הכוללות הגברה של הגן המבוקש בדגימה וזיהויו באמצעות טכניקות מתוחכמות אלו. 
במעבדה המיקרוביולוגית בבית החולים נמצא היום הציוד המתקדם והמהיר ביותר לאבחון מחלות זיהומיות. המהפכה המשמעותית ביותר באבחון חיידקים ופטריות במיקרוביולוגיה הקלאסית הינה מערכת .VITEK MS מערכת זו הינה מערכת  Mass Spectrometer העובדת בשיטת  MALDI-TOF   (Matrix Assisted Laser Desorption Time of Flight) המאפשרת זיהוי של מיקרואורגניזמים בתוך דקות בודדות. מערכת זו עובדת בשיתוף פעולה עם מכשיר ה  VITEK 2 (מערכת אוטומטית לזיהוי ורגישות חיידקים לתכשירי אנטיביוטיקה שונים).      
אבחון מהיר של החיידק מאפשר טיפול אנטיביוטי מתאים בהתאם לסוג החיידק ולעתים אף מציל חיים.

מערכת נוספת שהביאה מהפכה בתחום המיקרוביולוגיה המולקולרית הינה מערכת  Biofire FilmArray המאבחנת בו זמנית 16-22 פתוגניים בטכנולוגית nested multiplex PCR, ישירות מדגימה תוך שעה. בדגימה אחת של נבדק ניתן לבדוק חיידקים, וירוסים, פטריות ופרזיטים בדגימות של Cerebrospinal fluid (CSF), צואות, דרכי נשימה ותרביות דם חיוביות. 
שיטה נוספת לאבחון מולקולרי מהיר היא מערכת ה- GeneXpert. במעבדה שלנו מבצעים במערכת זו בדיקות לאבחון: חיידק השחפת Mycobacterium tuberculosis (MTB), החיידקים העמידים  Staphylococcus aureus העמידים למתיצילין, חיידקי CPE והחיידק הנוזוקומיאלי הגורם לשילשולים  Clostridium difficle. בנוסף מאבחנים את הוירוסים: Enterovirus הגורמים לדלקת קרום המוח ואת וירוסי החורףInfluenza & RSV   וכיום אף את וירוס הקורונה .SARS Cov-2
אבחון מהיר תוך דקות של מחלת הקורונה מאפשר בידוד מהיר של החולים למניעת הדבקה של חולים נוספים וצוותים רפואיים.

תחומי מחקר עיקריים בשיתוף עם המעבדה:
1.    מחקרים בנושא מחלות המועברות מהאם לילוד. תחום מחקרי חדש וחשוב הוא איתור מוקדם של CMV מולד בקרב יילודים וזאת על מנת לאפשר טיפול מוקדם בכדי למזער סיבוכים (נוירו-התפתחותיים) עתידיים.
2.    מחקרים פורצי דרך בתחום מחלת השעלת, מחלה קטלנית שפוגעת בתינוקות קטנטנים למרות החיסון הקיים. המחקרים בודקים את יעילות החיסון, התגובה החיסונית לחיסון. מחקר שפורסם לאחרונה תרם להכנסת חיסון השעלת כשגרה לנשים בהריון. ממצאי עבודות השעלת שנעשו על תזמון החיסון בזמן הריון, יושמו בהנחיות בינלאומיות בארה"ב, קנדה וישראל.
3.    מחקרים העוסקים באבחון וטיפול במחלות המועברות במגע מיני (STD). 

מרפאת STD - אבחון וטיפול במחלות המועברות במגע מיני:
המרפאה לאבחון מחלות המועברות במגע מיני Sexually Transmitted Diseases) STD) היא הראשונה מסוגה בארץ. בשיתוף מומחים למחלות זיהומיות, אורולוגים וגניקולוגים נבנה דגם ייחודי ארצי שבו נבדקים חולים חשודים במחלות מין בעזרת שיטות מעבדה רגישות ייחודיות ובהתאם לממצאים ניתן טיפול מתאים.